Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms