Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP2Q9BX26 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms