Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms