Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms