Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF559Q9BR84 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms