Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms