Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF11Q99590 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms