Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms