Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms