Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms