Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms