Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms