Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD8Q96LT4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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