Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms