Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPNS2Q96L46 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms