Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC41A2Q96JW4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms