Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYTL4Q96C24 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYTL4Q96C24 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms