Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1AQ96AJ9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms