Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms