Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC29Q8NA56 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTC29Q8NA56 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms