Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms