Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FOXP4Q8IVH2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP4Q8IVH2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms