Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE3BQ7Z3V4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms