Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms