Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms