Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL1

USP54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, humanhuman

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Length 1,684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54Q70EL1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP54Q70EL1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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