Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
USP31Q70CQ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms