Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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FAM43BQ6ZT52 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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FAM43BQ6ZT52 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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FAM43BQ6ZT52 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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FAM43BQ6ZT52 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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FAM43BQ6ZT52 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM43BQ6ZT52 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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