Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFXL1Q6ZNB6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms