Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms