Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF7Q6Q0C0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms