Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC174Q6PII3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms