Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6P435 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6P435 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q6P435 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q6P435 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q6P435 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q6P435 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms