Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN1Q6NZI2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms