Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms