Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNS3Q68CZ2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNS3Q68CZ2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNS3Q68CZ2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNS3Q68CZ2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNS3Q68CZ2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNS3Q68CZ2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNS3Q68CZ2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNS3Q68CZ2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNS3Q68CZ2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNS3Q68CZ2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNS3Q68CZ2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms