Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CLQ60I27 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms