Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM236Q5W0B7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM236Q5W0B7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms