Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms