Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP350Q5VT06 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP350Q5VT06 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP350Q5VT06 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP350Q5VT06 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms