Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms