Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TDRD12Q587J7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms