Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms