Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms