Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSMPQ1L6U9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSMPQ1L6U9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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