Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms