Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
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