Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM187BQ17R55 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms