Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms