Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSRP2Q16527 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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